Método de pago: cuándo te pagan
Tiene solo dos valores. PUE, pago en una sola exhibición, cuando te pagan completo al momento o antes de emitir la factura. PPD, pago en parcialidades o diferido, cuando te van a pagar después o en partes.
Esta es la decisión que importa. Si pones PUE, la factura se considera pagada y no necesitas nada más. Si pones PPD, estás diciendo que el dinero llegará después, y cuando llegue tendrás que emitir un complemento de pago.
Forma de pago: con qué te pagan
Efectivo, transferencia, tarjeta de crédito, tarjeta de débito, cheque, monedero electrónico. Es el medio.
Cuando el método es PPD, la forma de pago se pone como "por definir" (clave 99), porque todavía no sabes con qué te van a pagar. Cuando el método es PUE, debes indicar la forma real.
El error más común
Poner PUE con transferencia porque "así se pone siempre", cuando en realidad el cliente te va a pagar a 30 días. La factura queda como pagada ante el SAT, pero el dinero no ha llegado. Si después el cliente paga en dos partes, no hay forma de reflejarlo correctamente.
Al revés también pasa: poner PPD cuando ya te pagaron. Entonces el SAT espera un complemento que nunca llega y la factura queda abierta.
La regla práctica
Si el dinero ya está en tu cuenta o lo estará antes de que termine el mes en que facturas, PUE con la forma real. Si te van a pagar después del cierre del mes o en varias partes, PPD y luego complemento por cada pago.